More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1793 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 901 aa  1774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.94 
 
 		 1344 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.65 
 
 		 1334 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1657 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  33.3 
 
 		 1265 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.35 
 
 		 1240 aa  307  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.01 
 
 		 1733 aa  306  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  34.59 
 
 		 1699 aa  301  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.09 
 
 		 1711 aa  287  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  43.46 
 
 		 885 aa  279  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 		 1481 aa  262  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1230 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 		 1686 aa  252  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1401 aa  251  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 		 1760 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1510 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.34 
 
 		 1236 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.5 
 
 		 1823 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.92 
 
 		 1357 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  29.73 
 
 		 1301 aa  195  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1152 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1073 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.55 
 
 		 1598 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  27.65 
 
 		 1308 aa  188  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1157 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.33 
 
 		 1599 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.15 
 
 		 1583 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 972 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.16 
 
 		 1256 aa  174  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.38 
 
 		 1623 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.58 
 
 		 902 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.43 
 
 		 1398 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 1078 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1026 aa  168  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.49 
 
 		 865 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1355 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.25 
 
 		 1547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  34.4 
 
 		 1194 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 1013 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.45 
 
 		 1626 aa  162  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.48 
 
 		 833 aa  160  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 973 aa  150  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 		 947 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.25 
 
 		 1190 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 969 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 969 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 		 1684 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.74 
 
 		 919 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.05 
 
 		 682 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 		 1046 aa  138  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  31.04 
 
 		 897 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 965 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 1032 aa  135  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.21 
 
 		 828 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.55 
 
 		 737 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.21 
 
 		 1491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  27.13 
 
 		 994 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  33.11 
 
 		 461 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.34 
 
 		 924 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.79 
 
 		 1267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.78 
 
 		 716 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1392 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1432 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.61 
 
 		 729 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.23 
 
 		 1163 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  31.99 
 
 		 405 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.79 
 
 		 806 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 1080 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.75 
 
 		 1363 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.8 
 
 		 1656 aa  118  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.91 
 
 		 696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 1353 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.35 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 		 1063 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  28.6 
 
 		 1092 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.4 
 
 		 1652 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.4 
 
 		 1617 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.55 
 
 		 1075 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  27.88 
 
 		 1089 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  35.48 
 
 		 652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 1075 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.13 
 
 		 1609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.47 
 
 		 898 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 1005 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  27.88 
 
 		 1075 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  31.16 
 
 		 1766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.43 
 
 		 757 aa  112  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1789 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 1221 aa  111  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.57 
 
 		 657 aa  111  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.92 
 
 		 1217 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  33.64 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 		 1161 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 		 1161 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.21 
 
 		 1364 aa  110  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 1014 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.94 
 
 		 1607 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>