More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1738 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  51.09 
 
 
203 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  52.2 
 
 
317 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  50.6 
 
 
187 aa  174  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.32 
 
 
316 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  54.3 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  39.01 
 
 
191 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  50.86 
 
 
191 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  50 
 
 
315 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  48.04 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.36 
 
 
192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  45.76 
 
 
189 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  43.71 
 
 
171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  43.45 
 
 
194 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  46.78 
 
 
194 aa  157  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.18 
 
 
190 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  45.41 
 
 
313 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.25 
 
 
203 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  45.12 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.09 
 
 
194 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  44.37 
 
 
304 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  43.41 
 
 
196 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  45.29 
 
 
182 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.11 
 
 
193 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.88 
 
 
192 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  43.58 
 
 
189 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  45.29 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  45.4 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.94 
 
 
207 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  46.84 
 
 
194 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  43.26 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  42.94 
 
 
212 aa  144  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  46.79 
 
 
312 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  47.47 
 
 
197 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  42.7 
 
 
207 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.07 
 
 
236 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  41.49 
 
 
215 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  43.75 
 
 
517 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  39.64 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  43.12 
 
 
517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  35.52 
 
 
189 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  46.36 
 
 
153 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.07 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.83 
 
 
197 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  40.78 
 
 
193 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  42.38 
 
 
192 aa  134  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.43 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  42.68 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  43.9 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.59 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  43.71 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  37.2 
 
 
192 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  37.74 
 
 
191 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.41 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  40.11 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  36.98 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.34 
 
 
198 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  36.46 
 
 
228 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  40.23 
 
 
194 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  39.77 
 
 
198 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  38.33 
 
 
207 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  40.41 
 
 
159 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  36.99 
 
 
198 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  38.46 
 
 
175 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  37.76 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  39.01 
 
 
160 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.86 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  40.28 
 
 
159 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.67 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  42.36 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  36.48 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  36.25 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  35.86 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.81 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  38.19 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  42.11 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.81 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.87 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.87 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.98 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  32.84 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.2 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  25.79 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  32.85 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  35.2 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0251  hexapaptide repeat-containing transferase  32.87 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  34.42 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  32.41 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  38.24 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  29.93 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  30.08 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  31.47 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  39.22 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  36.36 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  36.67 
 
 
254 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.14 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  33.82 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>