137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1726 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.5 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  33.5 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  32.38 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  39.26 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.42 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  36.64 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  35.83 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  36.64 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  36.64 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  40.57 
 
 		 539 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.03 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38 
 
 		 519 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  41.07 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.03 
 
 		 172 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  35.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  37.29 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  38.33 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 869 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 		 593 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  30.66 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.1 
 
 		 565 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.12 
 
 		 544 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.12 
 
 		 544 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.72 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.62 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.4 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  40.35 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  37.96 
 
 		 576 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.08 
 
 		 544 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.05 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.46 
 
 		 549 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 590 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.61 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  39.05 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.87 
 
 		 547 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 121 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 559 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  32.7 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.14 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  29.75 
 
 		 125 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.76 
 
 		 547 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.17 
 
 		 544 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 127 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  42 
 
 		 512 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.91 
 
 		 549 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  32.63 
 
 		 663 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 121 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  35.25 
 
 		 578 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 121 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 124 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  31.39 
 
 		 697 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 		 571 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  32.82 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 		 121 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.71 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 120 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  34.09 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  30.12 
 
 		 546 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  30.94 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 649 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  28.32 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  30.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>