90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1613 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 160 aa  318  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  51.25 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  52.23 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  50.62 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  48.75 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  51.88 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  48.75 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  48.12 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  50 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  46.88 
 
 		 195 aa  140  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  45.62 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  46.88 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  43.4 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  47.5 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  38.75 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  38.75 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  38.75 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  38.67 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  25.95 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  25.93 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  27.95 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  27.95 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  27.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  27.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  27.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  27.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  25.15 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  22.64 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  27.33 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  25.5 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  24.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  24.16 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  24.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  45.71 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  24.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  24.16 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  23.08 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  43.64 
 
 		 652 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 674 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  28.08 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  23.75 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.45 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 676 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.29 
 
 		 697 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 672 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  26.67 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  55.32 
 
 		 662 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  27.95 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  35.62 
 
 		 720 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 666 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  37.66 
 
 		 613 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 764 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 666 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 666 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.85 
 
 		 664 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  28.89 
 
 		 332 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 666 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  37.1 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 658 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  37.7 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.77 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 		 341 aa  42  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  25.64 
 
 		 401 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.77 
 
 		 335 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30.77 
 
 		 650 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 684 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.81 
 
 		 597 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 569 aa  40.8  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  29.21 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 688 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5877  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50 
 
 		 422 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>