More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1612 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
393 aa  745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  69.97 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  70.65 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.51 
 
 
386 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  58.16 
 
 
436 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  61.95 
 
 
404 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  61.44 
 
 
395 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  57.59 
 
 
409 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  62.18 
 
 
394 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  60.77 
 
 
436 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  61.01 
 
 
401 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  60.11 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  60.77 
 
 
401 aa  332  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  55.11 
 
 
399 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 
384 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
384 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
384 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
388 aa  289  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  56.03 
 
 
387 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.86 
 
 
385 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  49.6 
 
 
388 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  48.13 
 
 
373 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  39.06 
 
 
403 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.31 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  36.58 
 
 
400 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 
407 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.44 
 
 
407 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.42 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.42 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.42 
 
 
407 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.15 
 
 
407 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 
407 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.42 
 
 
393 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.42 
 
 
393 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.27 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  31.64 
 
 
399 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.64 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.64 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.64 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.64 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.64 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
412 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.81 
 
 
399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 
399 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 
427 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 
414 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 
400 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
405 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 
408 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
391 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
411 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 
381 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 
587 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
586 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.32 
 
 
586 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.56 
 
 
587 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 
586 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 
747 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.46 
 
 
587 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 
586 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 
782 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
585 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.12 
 
 
585 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.82 
 
 
585 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.82 
 
 
585 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
586 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.7 
 
 
720 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 
656 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
585 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 
745 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  30.22 
 
 
598 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
777 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 
757 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  30.19 
 
 
741 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
664 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  27.69 
 
 
663 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
771 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  27.69 
 
 
663 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.69 
 
 
669 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
666 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 
652 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 
764 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 
762 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
710 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.93 
 
 
671 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 
741 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 
668 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
581 aa  89  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 
657 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>