More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1603 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  62.57 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  91.3  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 228 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.42 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  24.08 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.46 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>