177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1578 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.39 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  58.03 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  54.92 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  55.07 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.36 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  58.89 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.08 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  55.11 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  44.16 
 
 		 281 aa  225  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  52.75 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  47.08 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  46.35 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  46.35 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  46.35 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  47.57 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  49.12 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  47.27 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  46.55 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  41.01 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  45.05 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  43.05 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  47.58 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  43.64 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  46.59 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  49.12 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  46.47 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  43.8 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  43.8 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  43.33 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  43.38 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  46.42 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  46.24 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.28 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  45.32 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  45.32 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.98 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  46.91 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  41.39 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  44.94 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  47.96 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  41.49 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  46.94 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.79 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  43.61 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  45.05 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.71 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  47.43 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  41.24 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  41.24 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  41.24 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  41.24 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  49.65 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.43 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  44.87 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.59 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  43.02 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.08 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.28 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  46.58 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.41 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  46.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  46.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  46.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  39.78 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  42.22 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  45.9 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  47.39 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  42.57 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  37.69 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.53 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  43.98 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.03 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  44.61 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  42.44 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  42.44 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  42.44 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  37.74 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  45.77 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.62 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  41.28 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3133  hypothetical protein  45.64 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>