More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1469 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  57.76 
 
 
902 aa  912    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  52.93 
 
 
907 aa  822    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  50.39 
 
 
899 aa  748    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  47.18 
 
 
872 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  50.93 
 
 
909 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  56.27 
 
 
821 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  55.84 
 
 
903 aa  905    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  47.82 
 
 
920 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  44.51 
 
 
909 aa  655    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  53.59 
 
 
976 aa  853    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  55.53 
 
 
950 aa  961    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  44.48 
 
 
894 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  55.48 
 
 
893 aa  867    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  71.37 
 
 
926 aa  1202    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  100 
 
 
902 aa  1767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  53.72 
 
 
887 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
901 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  51.5 
 
 
868 aa  730    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  49.83 
 
 
899 aa  806    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  52.18 
 
 
881 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  43.65 
 
 
907 aa  611  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  43.58 
 
 
934 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  44.33 
 
 
907 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  42.99 
 
 
831 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  40.98 
 
 
883 aa  572  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  42.9 
 
 
926 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  41.22 
 
 
911 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
909 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  39.78 
 
 
908 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1998  CoA-binding domain-containing protein  41.75 
 
 
977 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0769955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  39.43 
 
 
926 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  40.45 
 
 
904 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  36.74 
 
 
886 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2950  CoA-binding  43.5 
 
 
707 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
867 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  37.25 
 
 
887 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
775 aa  445  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
883 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  39.91 
 
 
771 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1913  CoA-binding domain protein  35.43 
 
 
852 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.38 
 
 
696 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.72 
 
 
697 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  36.39 
 
 
698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.11 
 
 
698 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.92 
 
 
911 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.01 
 
 
711 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.69 
 
 
699 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  35.12 
 
 
706 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  32.78 
 
 
712 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.23 
 
 
929 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  35.26 
 
 
700 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  40.55 
 
 
637 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  30.44 
 
 
701 aa  360  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.66 
 
 
918 aa  357  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.87 
 
 
915 aa  348  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 
921 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 
696 aa  347  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.48 
 
 
920 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.7 
 
 
912 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.03 
 
 
707 aa  330  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  30.42 
 
 
697 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
704 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
893 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.29 
 
 
669 aa  321  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.1 
 
 
698 aa  320  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.98 
 
 
695 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.33 
 
 
699 aa  319  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.15 
 
 
711 aa  319  2e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  31.27 
 
 
889 aa  318  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.1 
 
 
905 aa  317  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  28.77 
 
 
698 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
903 aa  312  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  31 
 
 
697 aa  311  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.04 
 
 
892 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.05 
 
 
904 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.26 
 
 
903 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.56 
 
 
895 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  29.7 
 
 
703 aa  303  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.03 
 
 
913 aa  298  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  29.22 
 
 
702 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.75 
 
 
900 aa  295  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 
702 aa  293  9e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
706 aa  293  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.49 
 
 
892 aa  290  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  31.47 
 
 
704 aa  290  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.69 
 
 
897 aa  284  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
897 aa  278  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.24 
 
 
907 aa  277  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  31.19 
 
 
727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
893 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.26 
 
 
728 aa  275  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
899 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.01 
 
 
699 aa  268  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  32.27 
 
 
897 aa  268  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
898 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  28.31 
 
 
900 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  30.04 
 
 
911 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
896 aa  266  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
896 aa  265  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>