More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1466 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  100 
 
 
282 aa  537  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  66.78 
 
 
280 aa  345  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  62.59 
 
 
291 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  58.87 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  57.35 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  58.6 
 
 
282 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  53.9 
 
 
288 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  56.03 
 
 
288 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  56.93 
 
 
627 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 
282 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.3 
 
 
278 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  55 
 
 
287 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  56.36 
 
 
687 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  54.96 
 
 
276 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
289 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  57.53 
 
 
272 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  52.6 
 
 
301 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  52.8 
 
 
297 aa  237  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  54.12 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  43.58 
 
 
305 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.73 
 
 
419 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  50.51 
 
 
301 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  53.17 
 
 
298 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  50.57 
 
 
310 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.06 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  53.14 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  51.32 
 
 
375 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.35 
 
 
282 aa  208  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  49.47 
 
 
283 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  47.18 
 
 
284 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
288 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  47.43 
 
 
291 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  50 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.07 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.18 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 
299 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  46.34 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.95 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.55 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.85 
 
 
289 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
285 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  47.35 
 
 
278 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 
284 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  48.43 
 
 
285 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 
278 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  49.12 
 
 
279 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.95 
 
 
292 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.18 
 
 
289 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  47.35 
 
 
335 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 
283 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  49.46 
 
 
270 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  45.45 
 
 
285 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  44.95 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.6 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.82 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  42.41 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  46.18 
 
 
289 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  45.49 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 
295 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  38.97 
 
 
274 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  38.97 
 
 
274 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.53 
 
 
284 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
284 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.81 
 
 
276 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  44.88 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  40.32 
 
 
272 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  43.06 
 
 
284 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.26 
 
 
285 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.83 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.83 
 
 
289 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  38.69 
 
 
272 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  43.88 
 
 
296 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  49.82 
 
 
269 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.31 
 
 
280 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
312 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
304 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.55 
 
 
284 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  43.86 
 
 
284 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.3 
 
 
287 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.95 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  45.86 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  43.01 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.4 
 
 
290 aa  171  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  35.93 
 
 
276 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  44.66 
 
 
272 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.41 
 
 
289 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  39.19 
 
 
279 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.32 
 
 
277 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>