153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1458 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 		 410 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  56.07 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  50.23 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  50 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  44.7 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  50.79 
 
 		 457 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  45.99 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  46.8 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  34.28 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  33.81 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.09 
 
 		 460 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  28.86 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  32.63 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  32.08 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  31.03 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  35.8 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  31.41 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  32.49 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  34.99 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  30.05 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  30.41 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  31.21 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  30.41 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  29.82 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  29.59 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  29.82 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  30.05 
 
 		 450 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  30.8 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  30.18 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  33.49 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  30.05 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  30.05 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  30.28 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.65 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  29.91 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  29.91 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  29.91 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 451 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  29.59 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  30 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  28.92 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  29.51 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  32.8 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  27.96 
 
 		 442 aa  169  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.86 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 440 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  28.97 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  28.97 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.97 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  28.71 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.74 
 
 		 440 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  28.74 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.23 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 		 432 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  30.51 
 
 		 435 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  27.09 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  31.19 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  31.35 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.52 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.09 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.14 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.82 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.6 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  26.53 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  27.46 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  28.72 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  26.76 
 
 		 489 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  29.83 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.99 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  26.59 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.77 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.77 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.77 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.55 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  26.37 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  26.37 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>