More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1426 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  70.35 
 
 		 598 aa  789    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.41 
 
 		 646 aa  921    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.98 
 
 		 638 aa  1007    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  59.76 
 
 		 609 aa  644    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  73.92 
 
 		 641 aa  904    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.35 
 
 		 680 aa  830    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  73.24 
 
 		 646 aa  905    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  75.36 
 
 		 630 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.26 
 
 		 608 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 623 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.32 
 
 		 648 aa  938    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  74.04 
 
 		 643 aa  912    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.03 
 
 		 644 aa  945    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73 
 
 		 648 aa  939    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.6 
 
 		 681 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  76.13 
 
 		 633 aa  908    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.43 
 
 		 644 aa  935    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.98 
 
 		 646 aa  957    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.57 
 
 		 598 aa  827    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.33 
 
 		 621 aa  803    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.68 
 
 		 637 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.65 
 
 		 637 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.32 
 
 		 648 aa  938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.54 
 
 		 627 aa  932    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.98 
 
 		 589 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  42.04 
 
 		 576 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  38.64 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.66 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.83 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.5 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.01 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.86 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.31 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  39.15 
 
 		 576 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.81 
 
 		 543 aa  361  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  39.54 
 
 		 575 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.46 
 
 		 539 aa  351  3e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  40.61 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  34.13 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.46 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 		 566 aa  344  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 		 546 aa  345  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.25 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.01 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.74 
 
 		 584 aa  340  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  36.38 
 
 		 594 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.35 
 
 		 552 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.55 
 
 		 592 aa  336  7e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.01 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.76 
 
 		 592 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  35.64 
 
 		 598 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.11 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.76 
 
 		 583 aa  330  7e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.4 
 
 		 584 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  35.42 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.13 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.89 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.74 
 
 		 591 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.74 
 
 		 591 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.4 
 
 		 595 aa  324  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  35.58 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.68 
 
 		 592 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.98 
 
 		 575 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.68 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.76 
 
 		 602 aa  324  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.14 
 
 		 583 aa  324  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.28 
 
 		 597 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.42 
 
 		 591 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.94 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.47 
 
 		 599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.25 
 
 		 592 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.37 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.83 
 
 		 600 aa  320  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.99 
 
 		 595 aa  319  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.52 
 
 		 591 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 		 592 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.52 
 
 		 591 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 592 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 592 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 592 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 592 aa  319  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.46 
 
 		 592 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  35.24 
 
 		 596 aa  318  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.84 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.84 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.84 
 
 		 591 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  35.02 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.2 
 
 		 591 aa  317  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.59 
 
 		 616 aa  317  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.44 
 
 		 616 aa  317  6e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.56 
 
 		 593 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.18 
 
 		 599 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.2 
 
 		 591 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>