35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1371 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  273  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  72.79 
 
 		 136 aa  207  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  54.26 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  53.6 
 
 		 143 aa  143  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 168 aa  141  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  53.49 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  51.61 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  50.83 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  51.61 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  47.97 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  44.96 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.38 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  46.4 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  43.41 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  44 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  27.42 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  29.01 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.71 
 
 		 523 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>