More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1261 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  73.33 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  69.6 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  69.6 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  69.6 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  68.25 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  67.72 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  68.22 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  66.18 
 
 		 135 aa  183  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  71.54 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  62.6 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  60.47 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  60 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  61.07 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  61.11 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  61.29 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  58.91 
 
 		 175 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  57.78 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  55.86 
 
 		 150 aa  160  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  59.38 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  58.39 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  60 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  55 
 
 		 187 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  61.34 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  56.82 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  60.16 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  57.38 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  55.12 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  55.91 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  54.2 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  48.06 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  47.62 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  48.36 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  50.41 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  48.41 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.82 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.82 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  33.08 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  38.28 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  35.48 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  39.17 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.17 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.5 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  38.41 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  34.13 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  34.13 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  34.13 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  34.13 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.87 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  30.65 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  35.83 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  35.83 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  33.86 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  34.09 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  29.01 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  32.54 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  33.07 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  33.06 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  33.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.68 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  31.39 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>