176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1259 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1259  permease  100 
 
 		 334 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  55.25 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  55.21 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  61.22 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  59.93 
 
 		 352 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  56.31 
 
 		 350 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  49.1 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  54.49 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33.1 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  31.84 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  36.36 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  35.36 
 
 		 524 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  31.95 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  31.95 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.62 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  30.38 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  38.17 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  37.02 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  36.4 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  31.63 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30.8 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30.8 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  31.99 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  32.92 
 
 		 350 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  30.43 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  30.42 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  30.07 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  30.42 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33.21 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  31.38 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  28.62 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  27.52 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.04 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  27.67 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  32.99 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  28.47 
 
 		 524 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  34.5 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  42.96 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.42 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  32.06 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.76 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  34.11 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  28.08 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  37.31 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  34.75 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  24.9 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  48.54 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  27.92 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  27.31 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.97 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  25.16 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.64 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  30.42 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  33.9 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  35.25 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  29.47 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  27.84 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.3 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.23 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  30.61 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  22.17 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  27.81 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  29.17 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  24 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  23.03 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  28.47 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  30.54 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  26.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  25.87 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  33.07 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  33.9 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  20.37 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  36.78 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28.3 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  25.33 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  22 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  26.98 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  26.4 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  25.17 
 
 		 461 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  23.35 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  29.21 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  35.96 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  38.1 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  31.97 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  26.98 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  27.63 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  37.5 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  22.02 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  25.17 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>