More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1249 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1249  PhoH family protein  100 
 
 
654 aa  1307    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  79.4 
 
 
349 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  77.19 
 
 
376 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3467  PhoH family protein  71.13 
 
 
357 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3519  PhoH family protein  71.13 
 
 
357 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3456  PhoH-like protein  77.4 
 
 
319 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745001  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12394  phoH-like protein phoH1 (phosphate starvation-inducible protein psiH)  73.97 
 
 
352 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  73.06 
 
 
351 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2706  PhoH family protein  73.87 
 
 
353 aa  327  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3159  PhoH family protein  73.06 
 
 
343 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00307849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3453  PhoH family protein  72 
 
 
380 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3832  PhoH family protein  75.6 
 
 
329 aa  323  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2762  PhoH family protein  71.04 
 
 
361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0978111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1750  PhoH family protein  69.74 
 
 
376 aa  320  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224703  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  66.81 
 
 
354 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  67.63 
 
 
354 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  68.53 
 
 
348 aa  312  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  68.28 
 
 
344 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  70.91 
 
 
340 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  67.11 
 
 
345 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1576  PhoH family protein  72.81 
 
 
355 aa  306  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0922563  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0789  PhoH family protein  70.33 
 
 
333 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0567134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  63.52 
 
 
369 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3387  PhoH family protein  65.98 
 
 
375 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  66.37 
 
 
381 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1912  PhoH family protein  65.04 
 
 
345 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2188  PhoH family protein  68.72 
 
 
345 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2206  PhoH family protein  64.44 
 
 
333 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11730  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  65.91 
 
 
346 aa  283  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13470  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  67.14 
 
 
353 aa  283  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7049  PhoH family protein  62.22 
 
 
393 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1969  PhoH family protein  67.48 
 
 
362 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000703344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2232  PhoH family protein  66.5 
 
 
362 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00260346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1546  PhoH family protein  63.08 
 
 
350 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17250  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  58.37 
 
 
350 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.465991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12340  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  61.35 
 
 
357 aa  233  9e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  53.37 
 
 
328 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  49.77 
 
 
361 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50 
 
 
359 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  50.22 
 
 
323 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  53.55 
 
 
329 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  50 
 
 
323 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  54.55 
 
 
303 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  50.24 
 
 
323 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  47.11 
 
 
325 aa  204  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  47.42 
 
 
324 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2849  PhoH family protein  48.67 
 
 
338 aa  200  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1272  PhoH-like protein protein  50.43 
 
 
352 aa  200  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31699  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  48.56 
 
 
320 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  47.85 
 
 
319 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  47.93 
 
 
333 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  46.86 
 
 
316 aa  195  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1120  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  48.57 
 
 
319 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  45.45 
 
 
322 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1271  PhoH family protein  52.88 
 
 
329 aa  194  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  46.89 
 
 
320 aa  194  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  42.79 
 
 
320 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  47.85 
 
 
335 aa  193  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  45.79 
 
 
319 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  47.14 
 
 
333 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  45.45 
 
 
319 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  45.21 
 
 
351 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  45.93 
 
 
319 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  44.55 
 
 
348 aa  191  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  45.91 
 
 
328 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1643  PhoH family protein  49.78 
 
 
318 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00468401  hitchhiker  0.00249852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  47.6 
 
 
340 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  47 
 
 
332 aa  188  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1775  phosphate starvation-induced protein  49.07 
 
 
321 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.901151  normal  0.888471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12960  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  48.85 
 
 
326 aa  187  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  0.0890073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0579  PhoH family protein  44.64 
 
 
318 aa  186  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.818814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  48.37 
 
 
353 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  47.16 
 
 
340 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  46.05 
 
 
345 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  46.33 
 
 
322 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  45.89 
 
 
330 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  46.33 
 
 
322 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  49.53 
 
 
327 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1145  PhoH family protein  46.05 
 
 
317 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  46.15 
 
 
320 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  46.41 
 
 
315 aa  184  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  45.93 
 
 
315 aa  184  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  45.93 
 
 
315 aa  184  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  48.08 
 
 
340 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2524  PhoH family protein  49.52 
 
 
328 aa  183  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  48.31 
 
 
332 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  46.61 
 
 
339 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  46.73 
 
 
349 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  42.6 
 
 
322 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  48.31 
 
 
332 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  48.08 
 
 
340 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  49.04 
 
 
334 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  48.31 
 
 
332 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>