More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1203 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  55.03 
 
 
837 aa  678    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 
770 aa  1408    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  44.42 
 
 
790 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  47.5 
 
 
872 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  50.38 
 
 
859 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  47.97 
 
 
806 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  49.92 
 
 
806 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  45.58 
 
 
798 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  41.85 
 
 
819 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  44.63 
 
 
784 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.56 
 
 
792 aa  354  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  47.34 
 
 
781 aa  354  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  45.56 
 
 
812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  43.25 
 
 
772 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  40.6 
 
 
829 aa  282  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.5 
 
 
778 aa  276  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  47.26 
 
 
514 aa  251  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  34.97 
 
 
888 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.75 
 
 
818 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  42.92 
 
 
489 aa  237  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  38.58 
 
 
787 aa  233  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.16 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.91 
 
 
757 aa  221  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.68 
 
 
786 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  38.75 
 
 
867 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.55 
 
 
773 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.4 
 
 
780 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.82 
 
 
752 aa  210  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 
773 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  47.08 
 
 
519 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.89 
 
 
773 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  52.24 
 
 
488 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  30.01 
 
 
826 aa  198  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.02 
 
 
789 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.6 
 
 
773 aa  195  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
773 aa  194  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
654 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
773 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  47.11 
 
 
514 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.52 
 
 
796 aa  191  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  28.71 
 
 
795 aa  187  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
772 aa  187  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.78 
 
 
772 aa  187  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.03 
 
 
759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.68 
 
 
809 aa  183  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  55.29 
 
 
268 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  55.29 
 
 
268 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.72 
 
 
795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  39.43 
 
 
559 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  39.29 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.72 
 
 
808 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  26.5 
 
 
735 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 
363 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  26.22 
 
 
735 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.07 
 
 
814 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.55 
 
 
781 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.45 
 
 
734 aa  160  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.6 
 
 
851 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  46.71 
 
 
800 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  34.52 
 
 
656 aa  157  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
798 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.19 
 
 
840 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.27 
 
 
750 aa  154  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0804  ComEC/Rec2-related protein  27.45 
 
 
795 aa  151  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.569588  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.82 
 
 
749 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
846 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.1 
 
 
778 aa  150  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.03 
 
 
802 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  29.12 
 
 
291 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
292 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.83 
 
 
771 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.35 
 
 
772 aa  146  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
283 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.42 
 
 
775 aa  145  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.3 
 
 
840 aa  144  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 
320 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
295 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.46 
 
 
797 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.56 
 
 
833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.84 
 
 
860 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 
443 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.47 
 
 
766 aa  142  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.12 
 
 
860 aa  142  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  20.55 
 
 
738 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 
294 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.69 
 
 
839 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
406 aa  140  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  31.54 
 
 
801 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  42.05 
 
 
524 aa  140  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.84 
 
 
801 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 
284 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.2 
 
 
822 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.16 
 
 
761 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  32.93 
 
 
390 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.55 
 
 
840 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  33.33 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.67 
 
 
878 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  31.45 
 
 
847 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.97 
 
 
766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>