More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1178 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1104 aa  2068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 998 aa  176  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  50.18 
 
 		 952 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 974 aa  136  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.6 
 
 		 946 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  42.96 
 
 		 951 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  34.2 
 
 		 943 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 908 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 940 aa  110  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  36.86 
 
 		 925 aa  104  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 939 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 932 aa  99.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 877 aa  99.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  42.17 
 
 		 1074 aa  95.9  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  31.65 
 
 		 943 aa  93.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  40.26 
 
 		 947 aa  92.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 994 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 931 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 947 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  34.22 
 
 		 941 aa  81.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  34.52 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  36.51 
 
 		 336 aa  77.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  38.29 
 
 		 936 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.62 
 
 		 960 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 927 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 894 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.46 
 
 		 910 aa  72  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 881 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 881 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 876 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 1148 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 919 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 923 aa  71.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.2 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  39.88 
 
 		 855 aa  70.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 1151 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.26 
 
 		 904 aa  70.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 925 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.36 
 
 		 995 aa  69.7  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  32.59 
 
 		 913 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 923 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.63 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.19 
 
 		 937 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 937 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.19 
 
 		 937 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 910 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 938 aa  66.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 903 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  29.18 
 
 		 1264 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  44.55 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.17 
 
 		 893 aa  65.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 919 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.15 
 
 		 955 aa  65.1  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.64 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 911 aa  64.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 918 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 1141 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 919 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 919 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 1000 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.73 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  36.96 
 
 		 928 aa  62  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 926 aa  62  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.36 
 
 		 881 aa  61.6  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 1141 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 1141 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.54 
 
 		 940 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.41 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 189 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 948 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 973 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 953 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 954 aa  58.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50.85 
 
 		 929 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 1015 aa  58.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 1141 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 920 aa  57.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 900 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.2 
 
 		 892 aa  57.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 929 aa  57.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  46.25 
 
 		 959 aa  58.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 1084 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 236 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  43.01 
 
 		 913 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.71 
 
 		 913 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 181 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 900 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 956 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 431 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>