More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1151 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  39.4 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  38.55 
 
 		 699 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  35.18 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0548  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  32.05 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  30.16 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  32.81 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 337 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  29.1 
 
 		 289 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  29.63 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  30.89 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>