128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1122 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 687 aa  1333    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  65.68 
 
 		 651 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  59.74 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  59.74 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  59.57 
 
 		 665 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  52.56 
 
 		 675 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  57.42 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  57.47 
 
 		 672 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  47.53 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  46.13 
 
 		 642 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  46.96 
 
 		 632 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  44.48 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  44.48 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  44.44 
 
 		 646 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  44.93 
 
 		 637 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  41.13 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  42.93 
 
 		 664 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  40.59 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  41.82 
 
 		 681 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  38.82 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.13 
 
 		 631 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.89 
 
 		 731 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  35.86 
 
 		 718 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  41.92 
 
 		 651 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  40.41 
 
 		 708 aa  360  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  39.62 
 
 		 691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  39.1 
 
 		 708 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  40.68 
 
 		 679 aa  350  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  39.87 
 
 		 722 aa  350  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  38.29 
 
 		 697 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  44.78 
 
 		 671 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  39.72 
 
 		 736 aa  345  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  51.76 
 
 		 661 aa  343  8e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  39.82 
 
 		 719 aa  339  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  38.01 
 
 		 739 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  36.06 
 
 		 752 aa  323  8e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.12 
 
 		 687 aa  300  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.88 
 
 		 683 aa  300  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  39.08 
 
 		 711 aa  296  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  38.23 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  46.51 
 
 		 654 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.94 
 
 		 613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  41.58 
 
 		 310 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  44.4 
 
 		 319 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  42.49 
 
 		 322 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.81 
 
 		 319 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  41.34 
 
 		 328 aa  211  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  42.42 
 
 		 322 aa  207  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.84 
 
 		 651 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  34.8 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.39 
 
 		 307 aa  146  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  33.09 
 
 		 331 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  32.73 
 
 		 331 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  32.73 
 
 		 331 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  32.85 
 
 		 326 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  33.78 
 
 		 653 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.67 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  30.08 
 
 		 354 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.55 
 
 		 326 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.07 
 
 		 387 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  31.82 
 
 		 604 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.48 
 
 		 327 aa  99.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.52 
 
 		 277 aa  94.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  31.89 
 
 		 254 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  30.86 
 
 		 273 aa  91.3  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  25.64 
 
 		 274 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  26.14 
 
 		 277 aa  90.5  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  26.14 
 
 		 277 aa  90.5  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  26.52 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  25.38 
 
 		 265 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  29.86 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.68 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.16 
 
 		 264 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  35.98 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.31 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.96 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.91 
 
 		 294 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.52 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28 
 
 		 270 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  29.31 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.39 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.32 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  35.33 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.67 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  26.05 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.03 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.62 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.52 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.59 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.36 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  26.94 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>