More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1108 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  43.37 
 
 		 262 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  41.43 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  39.73 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 496 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.89 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 496 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.88 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  33.59 
 
 		 255 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  32.99 
 
 		 241 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 241 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 241 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 241 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  40.23 
 
 		 244 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.08 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  36.47 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  41.77 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  38.1 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  31.91 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  31.91 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  37.66 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  37.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.19 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.62 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  39.51 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 474 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  35.24 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 482 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  49.12 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  36.61 
 
 		 473 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 479 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  38.78 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 479 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 530 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 480 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 509 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  42.67 
 
 		 484 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 480 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.71 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.84 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.6 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  36.62 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 487 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  34.12 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 473 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 477 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.92 
 
 		 477 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 471 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>