More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1080 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  46.5 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  45.15 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  44.28 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  45.54 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  38.07 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  36.89 
 
 		 390 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.29 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2346  putative methyltransferase protein  40.65 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.183128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  32.43 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  44.17 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.82 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  22.71 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  40 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  23.19 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.57 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  34.81 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.12 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.38 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  23.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  42.61 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  24.19 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.61 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.55 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  37.25 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  28.14 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  23.67 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.37 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  23.19 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  34.45 
 
 		 783 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.71 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.02 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.52 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.56 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.89 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.8 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.93 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 352 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 382 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>