More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1060 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  53.82 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  52.65 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  51.16 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  52.9 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  45.23 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  46.2 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  47.3 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  46.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  46.54 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  46.54 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  46.67 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  45.21 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  46.11 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  51.11 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  51.11 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  51.11 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  47.45 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  50.64 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  44.41 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  41.44 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  41.44 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  46.03 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  35.97 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  36.16 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.61 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  35.61 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.65 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40.79 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  34.77 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  40.62 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.41 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  39.47 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.58 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.44 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  39.6 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  40.68 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.06 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  30.33 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.16 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.71 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  40.86 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  37.59 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  38.57 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  37.74 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  37.92 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.87 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.04 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  39.93 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.49 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  36 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  36.24 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  38.89 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  37.15 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.9 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  39.72 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  34.56 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  34.64 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  35.27 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  41.15 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  37.89 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  38.73 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  27.59 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  40.38 
 
 		 442 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  40.46 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  40.38 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  40.38 
 
 		 449 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  34.93 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  34.93 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  34.93 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  34.59 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  34.59 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  40.46 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  35.27 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.62 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>