More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1058 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  65.93 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  59.56 
 
 		 339 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  57.45 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  58.31 
 
 		 328 aa  334  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  54.75 
 
 		 327 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  58.31 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  54.37 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  54.88 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  52.48 
 
 		 337 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  66.97 
 
 		 367 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  52.83 
 
 		 321 aa  289  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  51.57 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 331 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  51.1 
 
 		 362 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  48.9 
 
 		 313 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  46.62 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 346 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  48.9 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 340 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  47.63 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  47.8 
 
 		 324 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  47.37 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  51.42 
 
 		 313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  50.78 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  50.78 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  50.78 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  47.3 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  46.42 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  46.2 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  44.79 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 333 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.6 
 
 		 338 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  46.71 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  45.89 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  46.52 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  47.32 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  45 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  45 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  45.62 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  49.37 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  45.75 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  45.17 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  44.83 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  46.67 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  44.51 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  44.51 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  44.51 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  44.51 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  45 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 258 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  44.2 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  44.2 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.06 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  40.57 
 
 		 317 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  47.02 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  44.27 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  42.04 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  44.2 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  43.67 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>