299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1016 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  55.91 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  51.75 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  47.1 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  47.29 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  48.09 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  44.53 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  44.96 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  45.74 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  44.96 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  45.95 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  43.8 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  43.45 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  46.15 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  47.13 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  45.34 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  45.17 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  46.69 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  42.64 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  41.78 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.74 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  43.41 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  41.7 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  41.86 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  39 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  39.05 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  37.69 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  38.06 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  37.55 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  29.06 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.74 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  35.06 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  27.95 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.39 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  30.45 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.81 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  30.68 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  30.16 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.09 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.16 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.33 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  26.91 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.81 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  25.59 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  23.44 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.36 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.82 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>