43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1008 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.77 
 
 		 296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  40.99 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  40.99 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  40.99 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  39.52 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  40 
 
 		 298 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.98 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.72 
 
 		 294 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  34.5 
 
 		 315 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  36.09 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.85 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.96 
 
 		 293 aa  74.7  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.18 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  34.65 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.81 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  32.72 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  32.72 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  32.72 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  29.68 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.06 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1112  hypothetical protein  28.22 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.900973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02690  hypothetical protein  35.05 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  30.66 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  29.38 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  33.56 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  28.08 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  30.38 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  28.67 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.29 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  27.08 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  30.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  30.5 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  27.94 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  27.78 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  29.1 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  27.61 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  26.9 
 
 		 270 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>