250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1004 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 437 aa  868    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  77.62 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.74 
 
 		 439 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  69.36 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  68.17 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.25 
 
 		 438 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  69.36 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  70.35 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.37 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.07 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.07 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.07 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.59 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.43 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  64.99 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  63.66 
 
 		 446 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  62.59 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  61.83 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  65.89 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  66.75 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.64 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  60.4 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.16 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.63 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  62 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.81 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  57.51 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.32 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  61.5 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.88 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.08 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.19 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  39.16 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 		 460 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 487 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 		 461 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 		 487 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 		 487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 		 487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 487 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5927  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 487 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 451 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6179  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  35.96 
 
 		 458 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0625  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1215  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 457 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.275384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 		 460 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.28 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 501 aa  233  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 479 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.99 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.532365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 		 485 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0227  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 		 456 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2760  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>