31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0977 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  54.76 
 
 
755 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  61.17 
 
 
751 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  56.74 
 
 
769 aa  833    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 
751 aa  1533    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  54.94 
 
 
745 aa  819    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  52.16 
 
 
756 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  61.25 
 
 
750 aa  916    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  28.3 
 
 
330 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.23 
 
 
327 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.51 
 
 
325 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  25.61 
 
 
324 aa  89  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.63 
 
 
344 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.72 
 
 
326 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  28.36 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  21.96 
 
 
338 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.49 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.18 
 
 
326 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  21.73 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  24.76 
 
 
347 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  20.85 
 
 
329 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  20.97 
 
 
322 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  24.73 
 
 
393 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  25.87 
 
 
335 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  28.09 
 
 
364 aa  54.3  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.6 
 
 
324 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  26.97 
 
 
364 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  26.97 
 
 
364 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  19.88 
 
 
339 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  21.38 
 
 
323 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  23.32 
 
 
345 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  26.58 
 
 
677 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>