232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0958 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  41.02 
 
 		 1009 aa  684    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  40.84 
 
 		 1000 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 1067 aa  2186    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  40.17 
 
 		 1052 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  42.41 
 
 		 1006 aa  674    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  37.56 
 
 		 1012 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  38.29 
 
 		 1069 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  38.27 
 
 		 1067 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  38.32 
 
 		 1008 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  37.5 
 
 		 984 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  39.59 
 
 		 1029 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1060 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1035 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  39.55 
 
 		 1022 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1007 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  37.83 
 
 		 971 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  39.94 
 
 		 1027 aa  611  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1059 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  37.9 
 
 		 1004 aa  598  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  39.67 
 
 		 965 aa  595  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  37.51 
 
 		 1009 aa  594  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  36.91 
 
 		 1063 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  37.58 
 
 		 992 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  36.66 
 
 		 1102 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1081 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  36.96 
 
 		 1010 aa  580  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  36.04 
 
 		 1112 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  37.98 
 
 		 1087 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  36.46 
 
 		 989 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  39.2 
 
 		 985 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  37.82 
 
 		 1051 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  36.23 
 
 		 1039 aa  542  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  36.99 
 
 		 999 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1039 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  40.9 
 
 		 905 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1041 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  36.93 
 
 		 1073 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  36.35 
 
 		 997 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  34.57 
 
 		 1016 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  33.06 
 
 		 991 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  35.98 
 
 		 990 aa  503  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1033 aa  499  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  34.6 
 
 		 969 aa  488  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  34.42 
 
 		 983 aa  488  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  33.9 
 
 		 1011 aa  486  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  33.87 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  33.62 
 
 		 1085 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  34.81 
 
 		 1022 aa  469  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  33.78 
 
 		 1078 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  33.94 
 
 		 1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  35.72 
 
 		 1002 aa  459  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  36.5 
 
 		 976 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1031 aa  452  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  33.27 
 
 		 1079 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  33.88 
 
 		 1023 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  32.01 
 
 		 1142 aa  420  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  27.98 
 
 		 1035 aa  331  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.8 
 
 		 1084 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.64 
 
 		 1045 aa  115  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.66 
 
 		 1044 aa  115  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.44 
 
 		 1034 aa  114  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1863  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.93 
 
 		 855 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  24.52 
 
 		 1028 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.03 
 
 		 1041 aa  110  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.15 
 
 		 1029 aa  108  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.22 
 
 		 1031 aa  108  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  25.66 
 
 		 1061 aa  108  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  25.51 
 
 		 1289 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.29 
 
 		 1084 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  25.11 
 
 		 1051 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4929  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1088 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.806169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  22.77 
 
 		 1059 aa  101  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.45 
 
 		 1032 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.47 
 
 		 1044 aa  100  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.32 
 
 		 1060 aa  99.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  21.44 
 
 		 1060 aa  97.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.52 
 
 		 1068 aa  97.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.36 
 
 		 1053 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.3 
 
 		 1032 aa  97.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.09 
 
 		 1067 aa  97.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.76 
 
 		 967 aa  96.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0028  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.47 
 
 		 1046 aa  97.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.77996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.76 
 
 		 967 aa  96.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.49 
 
 		 1074 aa  96.3  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.41 
 
 		 1040 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.82 
 
 		 1026 aa  95.9  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  23.25 
 
 		 1040 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.08 
 
 		 1052 aa  94.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  21.61 
 
 		 1060 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.62 
 
 		 1079 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.88 
 
 		 1022 aa  91.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.88 
 
 		 1022 aa  91.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1156  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  22.82 
 
 		 974 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.11 
 
 		 1035 aa  90.5  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04460  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.15 
 
 		 1010 aa  90.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  22.97 
 
 		 1044 aa  90.1  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0037  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.87 
 
 		 1061 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.68 
 
 		 1070 aa  88.6  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.16 
 
 		 1024 aa  87.4  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0969  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.73 
 
 		 973 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.301095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>