15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0922 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  64.92 
 
 		 555 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  53.6 
 
 		 572 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  53.27 
 
 		 569 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  52.45 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  52.38 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  52.09 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  47.71 
 
 		 568 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  46.79 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  50.56 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  47.69 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  46.89 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  54.58 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  48.15 
 
 		 56 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  33.06 
 
 		 450 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>