More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0881 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
391 aa  770    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  62.6 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60.77 
 
 
356 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60.26 
 
 
365 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60.26 
 
 
365 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60.26 
 
 
365 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  58.52 
 
 
383 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60.26 
 
 
364 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.42 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  53.59 
 
 
378 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.25 
 
 
382 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  55.78 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  52.45 
 
 
412 aa  315  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  49.74 
 
 
378 aa  311  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  48.72 
 
 
363 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 
411 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  47.76 
 
 
401 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  46.13 
 
 
370 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  64.95 
 
 
218 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  62.98 
 
 
215 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 
366 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  43.42 
 
 
412 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.64 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  52 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.72 
 
 
452 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  68.46 
 
 
137 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  59.54 
 
 
322 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
208 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  51.91 
 
 
133 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  48.46 
 
 
197 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
209 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  46.34 
 
 
198 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  43.55 
 
 
313 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  42.76 
 
 
194 aa  113  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.65 
 
 
213 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40 
 
 
205 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
211 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
212 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
209 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 
203 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.85 
 
 
254 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
202 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  43.55 
 
 
253 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  35.71 
 
 
213 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.55 
 
 
168 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  47.58 
 
 
132 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  43.55 
 
 
253 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  46.4 
 
 
126 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
213 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
253 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 
222 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.89 
 
 
222 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
201 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
214 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
200 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.5 
 
 
200 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.5 
 
 
200 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
209 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
215 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
201 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.17 
 
 
203 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
201 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.5 
 
 
200 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
215 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  43.85 
 
 
197 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  33.17 
 
 
203 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  33.17 
 
 
203 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.17 
 
 
203 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
217 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  31.63 
 
 
200 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
213 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.29 
 
 
205 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 
206 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  32.67 
 
 
203 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.67 
 
 
203 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  44.62 
 
 
198 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  41.73 
 
 
199 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 
198 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
220 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
223 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
213 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
225 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
214 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.18 
 
 
203 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
212 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
227 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.93 
 
 
196 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  41.35 
 
 
142 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  36.43 
 
 
154 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
221 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
221 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 
235 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 
210 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  34.34 
 
 
202 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  32.82 
 
 
202 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.67 
 
 
203 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.5 
 
 
217 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>