95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0841 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 252 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.76 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.06 
 
 		 230 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.58 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.56 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.56 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.18 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.16 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  35.57 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.25 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.84 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  39.26 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.92 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.68 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.66 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.69 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.51 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34 
 
 		 515 aa  99  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  35.04 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  38.76 
 
 		 306 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.01 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.11 
 
 		 531 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.25 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.08 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.2 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  37.13 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  29.75 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.36 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.26 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.11 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0297  hypothetical protein  30.29 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.625672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.27 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1324  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.65 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215746  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.83 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.45 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.45 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.64 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.9 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.33 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.02 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.9 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  31.23 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.15 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  24.18 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.71 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  23.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  30.59 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  22.53 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  23.63 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.04 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.63 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.24 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.11 
 
 		 134 aa  52.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.51 
 
 		 125 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.74 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.28 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.18 
 
 		 472 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  22.53 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  22.53 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 534 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.3 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.19 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0296  bifunctional sirohydrochlorin cobalt chelatase/precorrin-8X methylmutase  34.72 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  34.43 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  24.05 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.57 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.47 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.95 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.44 
 
 		 150 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.89 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.84 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.13 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.73 
 
 		 125 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  30.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.75 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.72 
 
 		 471 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.05 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.9 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.07 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  32.1 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.72 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2220  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.71 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.186484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.49 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.83 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.02 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.01 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.3 
 
 		 241 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>