81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0722 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
144 aa  295  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.6 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  45.19 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.37 
 
 
368 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.37 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  41.3 
 
 
344 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6096  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.5 
 
 
254 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  37.86 
 
 
493 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.37 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  40.91 
 
 
496 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  43.18 
 
 
349 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  42.68 
 
 
347 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  42.68 
 
 
354 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  35.66 
 
 
536 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  42.53 
 
 
330 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.53 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  39.58 
 
 
264 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.34 
 
 
260 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
211 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  37.11 
 
 
455 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.86 
 
 
269 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.23 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  36.52 
 
 
408 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  41.46 
 
 
418 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  38.78 
 
 
519 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  39.51 
 
 
537 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  35.79 
 
 
411 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  33.08 
 
 
503 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  33.98 
 
 
568 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  33.33 
 
 
419 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
183 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 
190 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  34.65 
 
 
503 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  38.27 
 
 
520 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  39.51 
 
 
588 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.32 
 
 
253 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.9 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.89 
 
 
370 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  35.45 
 
 
520 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.12 
 
 
187 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.96 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.26 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.7 
 
 
216 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.96 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.77 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.47 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  36.36 
 
 
575 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5369  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.31 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846692  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.66 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5680  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  34.21 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5330  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104787  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2824  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.31 
 
 
318 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.31 
 
 
318 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.74 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
257 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
376 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
445 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0270028  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
212 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
413 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.7 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 
328 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 
256 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.98 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0160  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 
328 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.32 
 
 
328 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.42 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 
235 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.63 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10117  hypothetical protein  28.32 
 
 
251 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.1 
 
 
247 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>