158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0712 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  55.54 
 
 
665 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  56.05 
 
 
682 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  58.59 
 
 
673 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  57.81 
 
 
664 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  64.77 
 
 
667 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  58.2 
 
 
652 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  57.81 
 
 
664 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  57.66 
 
 
664 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  56.74 
 
 
673 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  56.52 
 
 
696 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  100 
 
 
657 aa  1299    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  57.7 
 
 
673 aa  663    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  58.47 
 
 
669 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  62.95 
 
 
665 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  53.17 
 
 
699 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  55.26 
 
 
710 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  56.15 
 
 
677 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  57.91 
 
 
662 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  52.47 
 
 
699 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  58.05 
 
 
667 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  53.68 
 
 
658 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  58.14 
 
 
703 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  55.09 
 
 
656 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1103  protein of unknown function DUF255  56.79 
 
 
687 aa  595  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.491204  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  56.4 
 
 
682 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  49.63 
 
 
666 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  46.86 
 
 
685 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  42.79 
 
 
681 aa  532  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  45.73 
 
 
696 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  40.03 
 
 
686 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  45.68 
 
 
693 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  51.33 
 
 
596 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  43.95 
 
 
700 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  39.47 
 
 
686 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  38.62 
 
 
680 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  45.11 
 
 
678 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  47.81 
 
 
756 aa  485  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  39.45 
 
 
690 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  41.57 
 
 
699 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  40.76 
 
 
684 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  37.98 
 
 
681 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  39.66 
 
 
699 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  38.47 
 
 
711 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  43.95 
 
 
669 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  40.56 
 
 
669 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  34.42 
 
 
675 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  40.75 
 
 
694 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  34.66 
 
 
686 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  43.25 
 
 
660 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  40.98 
 
 
682 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.63 
 
 
700 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  37.85 
 
 
673 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  39.57 
 
 
700 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  42.32 
 
 
697 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  41.62 
 
 
672 aa  439  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  40.12 
 
 
676 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  42.58 
 
 
706 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  37.1 
 
 
680 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  43.11 
 
 
665 aa  432  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  41.85 
 
 
725 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  45.63 
 
 
718 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  39.55 
 
 
707 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.48 
 
 
676 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  36.85 
 
 
671 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  42.04 
 
 
679 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.49 
 
 
691 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  38.42 
 
 
711 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  34.74 
 
 
703 aa  422  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  41.06 
 
 
676 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  41.34 
 
 
681 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  45.69 
 
 
718 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  44.59 
 
 
718 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  40.38 
 
 
673 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  41.17 
 
 
677 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  38.49 
 
 
721 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  38.41 
 
 
733 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  45.26 
 
 
610 aa  412  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  35.81 
 
 
712 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  39.59 
 
 
700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  38.1 
 
 
723 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  39.02 
 
 
715 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  42.2 
 
 
680 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  38.6 
 
 
722 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  40.23 
 
 
705 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  39.05 
 
 
744 aa  405  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  40.41 
 
 
714 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37.93 
 
 
676 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  33.63 
 
 
681 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  37.79 
 
 
746 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  34.76 
 
 
670 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  38.79 
 
 
717 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  37.68 
 
 
750 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  42.47 
 
 
687 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  38.76 
 
 
687 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  37.29 
 
 
706 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  31.49 
 
 
687 aa  382  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02190  conserved hypothetical protein  36.25 
 
 
773 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.129596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  35.84 
 
 
737 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  37.32 
 
 
691 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  37.72 
 
 
666 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>