39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0701 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  100 
 
 		 373 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  41.35 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  39.8 
 
 		 198 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  36.65 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  37.27 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  30.71 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  37.14 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  27.7 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.93 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  27.83 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  31 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  36.99 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  59.74 
 
 		 514 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0056  hypothetical protein  53.01 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  29.09 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  26.84 
 
 		 191 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.37 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1443  peptidase domain protein  51.35 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  27.97 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5978  hypothetical protein  44.27 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128515  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  58.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  27.97 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  26.92 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  28.8 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  27.41 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  30.38 
 
 		 141 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.81 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  27.5 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  63.04 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  33.68 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  50 
 
 		 784 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  29.21 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 14916 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>