44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0651 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1240    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  53.57 
 
 		 99 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2754  hypothetical protein  36.27 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  35.71 
 
 		 233 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  45.26 
 
 		 113 aa  71.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  23.71 
 
 		 1039 aa  68.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  43.59 
 
 		 89 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  23.43 
 
 		 1034 aa  67.4  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0056  hypothetical protein  48 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0485848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0065  hypothetical protein  48 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425042  normal  0.0470908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0046  hypothetical protein  48 
 
 		 116 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.884886  hitchhiker  0.00802794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0277  putative CheA signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0654  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1002  hypothetical protein  41.98 
 
 		 85 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145256  normal  0.324413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1328  hypothetical protein  45.45 
 
 		 425 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0791  DivIVA domain protein  38.14 
 
 		 136 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1010  hypothetical protein  30.6 
 
 		 179 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2501  hypothetical protein  33.9 
 
 		 183 aa  51.6  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2585  hypothetical protein  32.75 
 
 		 164 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.13384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  58.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  53.33 
 
 		 218 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  61.54 
 
 		 274 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  63.16 
 
 		 271 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  58.97 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06790  hypothetical protein  29.1 
 
 		 199 aa  49.7  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00129974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  58.97 
 
 		 266 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  58.97 
 
 		 271 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  60.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  60.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1186  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  60.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2204  hypothetical protein  44.59 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00429968  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0114  hypothetical protein  26.53 
 
 		 567 aa  48.9  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.391457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  58.97 
 
 		 273 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  58.97 
 
 		 281 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  58.97 
 
 		 240 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1875  hypothetical protein  49.09 
 
 		 385 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.713684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  43.86 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2269  DivIVA domain protein  56.76 
 
 		 58 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1389  hypothetical protein  27.37 
 
 		 194 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000191938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  56.41 
 
 		 276 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>