79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0636 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  64.4 
 
 
511 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
523 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  56.7 
 
 
516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  57.96 
 
 
493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  56.68 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  57.96 
 
 
493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  57.96 
 
 
493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  55.85 
 
 
559 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  59.39 
 
 
522 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  56.11 
 
 
528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  49.52 
 
 
534 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  40.33 
 
 
539 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
528 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  37.71 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  38.71 
 
 
547 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  40.81 
 
 
586 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 
567 aa  327  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  42.01 
 
 
507 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  39.96 
 
 
508 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.85 
 
 
520 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 
534 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  38.89 
 
 
531 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  40.51 
 
 
584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  38.43 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.32 
 
 
538 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  37.73 
 
 
569 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  34.79 
 
 
541 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  36.86 
 
 
592 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  36.27 
 
 
573 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.64 
 
 
541 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  35.58 
 
 
572 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  39.2 
 
 
555 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
539 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.74 
 
 
585 aa  269  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
560 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  40.28 
 
 
537 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  38.21 
 
 
563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  38.85 
 
 
638 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.98 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  20.62 
 
 
493 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 
487 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.08 
 
 
658 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  22.81 
 
 
462 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  20.54 
 
 
492 aa  94  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.44 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  21.43 
 
 
469 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  21.34 
 
 
469 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  26.54 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  22.67 
 
 
566 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
968 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  23.48 
 
 
767 aa  70.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.22 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  23.88 
 
 
918 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  27.5 
 
 
745 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  24.65 
 
 
773 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.97174 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 
918 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  25 
 
 
758 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  23.72 
 
 
740 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
384 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1040  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
448 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000509262 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90238  predicted protein  24.08 
 
 
821 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  25.94 
 
 
739 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01930  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  25.82 
 
 
807 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70572  Phospho Mannno Transferase; dolichyl-P-mannose-protein mannosyltransferase  24.14 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0562818  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  22.73 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  22.73 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  28.07 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>