More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0634 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  42.99 
 
 		 1078 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  58.91 
 
 		 1062 aa  1097    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  68.69 
 
 		 1089 aa  1419    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  52.45 
 
 		 1161 aa  840    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  60.15 
 
 		 1050 aa  1184    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  40.91 
 
 		 1075 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  38.59 
 
 		 1232 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  52.7 
 
 		 1124 aa  964    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  39.91 
 
 		 1082 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  57.63 
 
 		 1067 aa  1044    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  54.91 
 
 		 1032 aa  1018    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1001 aa  2007    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  40.25 
 
 		 1033 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  46.78 
 
 		 1132 aa  763    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  69.39 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.75 
 
 		 1089 aa  612  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  40.09 
 
 		 1027 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  40.15 
 
 		 1127 aa  602  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  68.27 
 
 		 1156 aa  578  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  41.15 
 
 		 1174 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  58.35 
 
 		 1244 aa  475  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  51.54 
 
 		 414 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  55.56 
 
 		 446 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  51.94 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  51.09 
 
 		 411 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.61 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  42.13 
 
 		 414 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.97 
 
 		 759 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 		 770 aa  248  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 757 aa  247  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.87 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.87 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.87 
 
 		 747 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  34.87 
 
 		 753 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  34.87 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.87 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 		 753 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.43 
 
 		 639 aa  241  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.89 
 
 		 715 aa  241  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.89 
 
 		 741 aa  240  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 		 747 aa  240  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.93 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.93 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  27.65 
 
 		 639 aa  238  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.66 
 
 		 747 aa  238  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.82 
 
 		 732 aa  237  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.54 
 
 		 725 aa  237  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.73 
 
 		 739 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.86 
 
 		 758 aa  234  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  36.43 
 
 		 707 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.69 
 
 		 729 aa  232  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.26 
 
 		 766 aa  232  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.02 
 
 		 785 aa  230  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.47 
 
 		 742 aa  229  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  31.18 
 
 		 817 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  35.27 
 
 		 741 aa  228  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  35.42 
 
 		 768 aa  227  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.08 
 
 		 751 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.08 
 
 		 751 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.25 
 
 		 772 aa  226  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.93 
 
 		 735 aa  225  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  31.65 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  32.93 
 
 		 757 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  35.94 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  31.05 
 
 		 798 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 807 aa  222  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.28 
 
 		 755 aa  222  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.36 
 
 		 781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.07 
 
 		 828 aa  221  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.71 
 
 		 765 aa  220  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  34.97 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  35.31 
 
 		 744 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 748 aa  219  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  31.19 
 
 		 689 aa  219  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.73 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  33.11 
 
 		 736 aa  219  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 678 aa  218  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  33.58 
 
 		 738 aa  218  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 		 671 aa  218  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  34.02 
 
 		 678 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  33.41 
 
 		 688 aa  218  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 		 671 aa  217  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 738 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.12 
 
 		 831 aa  217  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.45 
 
 		 790 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.76 
 
 		 932 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  34.12 
 
 		 779 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  34.22 
 
 		 457 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  34.88 
 
 		 678 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  27.7 
 
 		 630 aa  216  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.22 
 
 		 830 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  31.86 
 
 		 681 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  34.88 
 
 		 812 aa  215  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  32.85 
 
 		 738 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.19 
 
 		 768 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  33.11 
 
 		 409 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.08 
 
 		 762 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.52 
 
 		 718 aa  214  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>