More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0561 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1344 aa  2592    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 1334 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  35.91 
 
 		 1265 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  37.3 
 
 		 1357 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.07 
 
 		 1686 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1553 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 1711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.36 
 
 		 1510 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 1481 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.46 
 
 		 1760 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 		 1236 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.98 
 
 		 1598 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.26 
 
 		 1240 aa  436  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.61 
 
 		 919 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.85 
 
 		 1583 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.73 
 
 		 1547 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1230 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.09 
 
 		 1599 aa  400  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 901 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  31.48 
 
 		 1733 aa  365  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.74 
 
 		 1652 aa  363  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  39.82 
 
 		 1217 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.33 
 
 		 1684 aa  357  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.56 
 
 		 1363 aa  354  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 		 1557 aa  354  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.2 
 
 		 1626 aa  352  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.95 
 
 		 1699 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  41.33 
 
 		 696 aa  345  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1552 aa  344  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.48 
 
 		 1398 aa  343  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.28 
 
 		 1163 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.85 
 
 		 924 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1355 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 1221 aa  331  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.54 
 
 		 1211 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31 
 
 		 1823 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1789 aa  330  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1367 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1229 aa  325  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  30.75 
 
 		 1301 aa  323  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.19 
 
 		 947 aa  321  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1196 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  35.08 
 
 		 1656 aa  312  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.95 
 
 		 1523 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.11 
 
 		 737 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  34.24 
 
 		 1661 aa  301  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1491 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  32.67 
 
 		 1364 aa  287  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 		 1188 aa  287  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1190 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.15 
 
 		 1177 aa  285  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.53 
 
 		 1247 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.78 
 
 		 1193 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.52 
 
 		 716 aa  279  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.23 
 
 		 1609 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  33.68 
 
 		 1399 aa  273  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 		 1161 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.58 
 
 		 1161 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1858 aa  269  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.94 
 
 		 1164 aa  269  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.72 
 
 		 1901 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  33.75 
 
 		 1454 aa  268  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.2 
 
 		 1868 aa  264  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.15 
 
 		 1831 aa  263  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  48.15 
 
 		 405 aa  262  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.45 
 
 		 1262 aa  261  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.54 
 
 		 1474 aa  259  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  46.52 
 
 		 652 aa  258  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 		 1443 aa  257  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.55 
 
 		 1256 aa  255  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.65 
 
 		 1190 aa  254  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.36 
 
 		 1213 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.85 
 
 		 865 aa  252  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.94 
 
 		 1607 aa  251  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.67 
 
 		 930 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  29.14 
 
 		 1308 aa  247  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  44.62 
 
 		 1401 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  50.16 
 
 		 675 aa  242  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  35.09 
 
 		 1214 aa  240  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1176 aa  240  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  32.49 
 
 		 1209 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  44.13 
 
 		 461 aa  237  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.88 
 
 		 1623 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1714 aa  236  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  39.36 
 
 		 885 aa  234  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1599 aa  233  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 		 1188 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.58 
 
 		 1208 aa  233  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.57 
 
 		 682 aa  232  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.47 
 
 		 1348 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 		 1016 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  44.82 
 
 		 540 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  31.17 
 
 		 1766 aa  222  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1304 aa  221  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  36.25 
 
 		 1152 aa  221  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.33 
 
 		 1242 aa  219  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.61 
 
 		 833 aa  219  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.68 
 
 		 1416 aa  218  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>