50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0505 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  43.9 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  48 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  47.16 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  54.63 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  45.45 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  46.15 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  42.8 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  45.87 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  46.12 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  46.12 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  40.52 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  44.39 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  43.38 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  34.63 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  34.08 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25.41 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  30.09 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  33.8 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  33.03 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.35 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  26.8 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  30.77 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  29.1 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  22.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  21.4 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  30.6 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  21.4 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  30.93 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.76 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  38.66 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06573  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182291  normal  0.0690952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  30.18 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  31.34 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  31.09 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  31.34 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  24.89 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  24.43 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  35.76 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  40 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  38.24 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  31.9 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  26.92 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>