More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0488 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
479 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  76.32 
 
 
488 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.85 
 
 
491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.79 
 
 
486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.18 
 
 
521 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.39 
 
 
498 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.3 
 
 
506 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57 
 
 
515 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.58 
 
 
480 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.33 
 
 
481 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.2 
 
 
491 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  57.71 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.08 
 
 
490 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.21 
 
 
490 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.22 
 
 
491 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.23 
 
 
470 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  54.3 
 
 
494 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58 
 
 
507 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.2 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 
471 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.3 
 
 
517 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.21 
 
 
488 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.92 
 
 
518 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  54.77 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.42 
 
 
483 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  55.21 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  53.21 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 
463 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
461 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  50.31 
 
 
502 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 
475 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.03 
 
 
484 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.87 
 
 
480 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.18 
 
 
465 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.25 
 
 
456 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.19 
 
 
456 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.19 
 
 
456 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 
496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.94 
 
 
460 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.34 
 
 
442 aa  324  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.94 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.98 
 
 
460 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.85 
 
 
437 aa  285  9e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.28 
 
 
440 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.83 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.79 
 
 
431 aa  282  7.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.9 
 
 
463 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.21 
 
 
444 aa  279  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.16 
 
 
428 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 
441 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.19 
 
 
441 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.66 
 
 
433 aa  277  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.74 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.68 
 
 
462 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.03 
 
 
433 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.03 
 
 
433 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.37 
 
 
433 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.17 
 
 
457 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  37.53 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.71 
 
 
436 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.46 
 
 
452 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  37.53 
 
 
429 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.8 
 
 
442 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.77 
 
 
467 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.12 
 
 
435 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.31 
 
 
443 aa  266  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 
431 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.25 
 
 
443 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.59 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.97 
 
 
471 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  36.86 
 
 
437 aa  262  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.75 
 
 
458 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.67 
 
 
446 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  35.94 
 
 
428 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.81 
 
 
465 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.92 
 
 
429 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.15 
 
 
452 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.11 
 
 
440 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 
438 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 
454 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.59 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  38.03 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  38.03 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.97 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.82 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 
431 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.97 
 
 
446 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  33.88 
 
 
473 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  35.82 
 
 
431 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.03 
 
 
431 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.43 
 
 
433 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.02 
 
 
434 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.03 
 
 
430 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  36.75 
 
 
434 aa  250  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  36.11 
 
 
430 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>