195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0453 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  85.51 
 
 		 556 aa  914    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  75.82 
 
 		 549 aa  860    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  81.72 
 
 		 561 aa  907    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  79.78 
 
 		 545 aa  872    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  84.34 
 
 		 549 aa  916    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  76.19 
 
 		 550 aa  845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  72.79 
 
 		 551 aa  813    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 550 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  70.44 
 
 		 558 aa  812    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  76.1 
 
 		 546 aa  828    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  84.34 
 
 		 549 aa  916    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  75.32 
 
 		 548 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  85.06 
 
 		 549 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  84.34 
 
 		 549 aa  916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  74.82 
 
 		 548 aa  833    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  84.7 
 
 		 549 aa  922    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  86 
 
 		 555 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  77.48 
 
 		 581 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  72.92 
 
 		 558 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  71.35 
 
 		 550 aa  789    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  85.92 
 
 		 548 aa  951    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  75.82 
 
 		 548 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  74.08 
 
 		 555 aa  791    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  83.39 
 
 		 542 aa  893    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  76.37 
 
 		 557 aa  830    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  73.87 
 
 		 558 aa  835    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  75.18 
 
 		 551 aa  845    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  83.79 
 
 		 554 aa  932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  72.24 
 
 		 548 aa  810    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  77.04 
 
 		 548 aa  843    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  80.51 
 
 		 545 aa  875    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  77.84 
 
 		 559 aa  873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  75 
 
 		 548 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  54.51 
 
 		 602 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  48.72 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  43.24 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  40.18 
 
 		 630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  35.25 
 
 		 666 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  28.43 
 
 		 838 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  36.46 
 
 		 649 aa  266  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  29.04 
 
 		 818 aa  259  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  30.61 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  38.22 
 
 		 720 aa  244  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  35.68 
 
 		 658 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  36 
 
 		 866 aa  242  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.49 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  32.84 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  33.59 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 		 449 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  33.93 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.92 
 
 		 531 aa  156  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.47 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 440 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  32.47 
 
 		 470 aa  150  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  30.86 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  30.61 
 
 		 652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  31.52 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  30.59 
 
 		 494 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.35 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.71 
 
 		 654 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.68 
 
 		 590 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.28 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 479 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  30.45 
 
 		 650 aa  127  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 451 aa  127  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  30.33 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 479 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.67 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 479 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 485 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.18 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 630 aa  94.7  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 886 aa  84.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 633 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  35.29 
 
 		 796 aa  83.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  33.13 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  33.13 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.96 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  34.91 
 
 		 768 aa  72.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  24.56 
 
 		 998 aa  71.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  31.36 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  26.09 
 
 		 796 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  32 
 
 		 794 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 788 aa  70.1  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  29.49 
 
 		 925 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  31.25 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  32.61 
 
 		 813 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>