More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0430 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  62.33 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.82 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.65 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  35.23 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.5 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>