More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0352 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  46.99 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  42.22 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  41.04 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  45.71 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  44.07 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  45.09 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  40.59 
 
 		 511 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.79 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  38.35 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  37.88 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 313 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  30.08 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  34.55 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.22 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.17 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.09 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  34.72 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  34.72 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  34.2 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  34.2 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  34.2 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.72 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  34.5 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.51 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.46 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  33.59 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  28.62 
 
 		 398 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.06 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  34.51 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  26.94 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  34.57 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  27.66 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.57 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  25.23 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.36 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  26.5 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.26 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.13 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  24.04 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  24.04 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  23.4 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.09 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  22.86 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  26.78 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  26.78 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.3 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  23.96 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.86 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  21.65 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25.86 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  22.56 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  24.08 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  22.56 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.86 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.86 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.86 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.43 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  21.65 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>