298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0316 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
125 aa  243  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  68.64 
 
 
123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  67.52 
 
 
130 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  68.75 
 
 
125 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  68.75 
 
 
125 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  64.1 
 
 
127 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  67.52 
 
 
125 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1419  dihydroneopterin aldolase  68.38 
 
 
123 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5369  dihydroneopterin aldolase  66.67 
 
 
124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  59.65 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  65.52 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  58.12 
 
 
310 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  55.46 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  56.52 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  53.85 
 
 
120 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  52 
 
 
126 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  59.32 
 
 
126 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  50.43 
 
 
135 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  55.17 
 
 
120 aa  120  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  50.43 
 
 
123 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  56.78 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  49.6 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  49.57 
 
 
119 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  52.99 
 
 
525 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  50.85 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  51.72 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  49.57 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  49.15 
 
 
841 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.86 
 
 
1211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  52.14 
 
 
612 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  49.57 
 
 
124 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  50.43 
 
 
372 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  53.1 
 
 
295 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  52.14 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  48.76 
 
 
470 aa  96.7  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  45.76 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  40.68 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  49.57 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  39.5 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  39.66 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  43.33 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  42.5 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  40.17 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.37 
 
 
305 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
125 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
122 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  36.44 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.07 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.2 
 
 
276 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  41.88 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.21 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  30.51 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  40.38 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233829  normal  0.020478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  41.41 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3081  dihydroneopterin aldolase  35.9 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00105376  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  33.05 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0329  dihydroneopterin aldolase  36.21 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1150  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00780302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3163  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.825966  normal  0.332579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1194  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.07568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1227  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00906194  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  41.18 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1298  dihydroneopterin aldolase  33 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  37 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  36 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  34.45 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  33 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  33.05 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  37.37 
 
 
291 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  34.69 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>