More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0314 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  82.91 
 
 		 222 aa  334  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  80.43 
 
 		 219 aa  310  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  74.87 
 
 		 202 aa  309  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  77.17 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  77.17 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  77.17 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  73.85 
 
 		 202 aa  300  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  71.43 
 
 		 202 aa  297  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  74.07 
 
 		 198 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  70.85 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  75.94 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  74.47 
 
 		 202 aa  281  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  71.51 
 
 		 206 aa  281  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  69 
 
 		 210 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  71.86 
 
 		 216 aa  278  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  71.57 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  69.7 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  72.19 
 
 		 205 aa  275  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  71.04 
 
 		 193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  70 
 
 		 200 aa  271  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  63.26 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  72.13 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  68.48 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  69.47 
 
 		 200 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  63.72 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  68.65 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  75.41 
 
 		 205 aa  264  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  68.28 
 
 		 199 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  66.15 
 
 		 214 aa  261  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 257 aa  256  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  66.31 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  64.17 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  66.84 
 
 		 195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  64.17 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  60.09 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  64.86 
 
 		 188 aa  247  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  63.64 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  65.22 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  62.57 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  63.64 
 
 		 189 aa  244  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  61.5 
 
 		 186 aa  242  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  58.82 
 
 		 188 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 		 187 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 		 188 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  66.31 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  56.15 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  62.77 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  60.44 
 
 		 189 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 189 aa  230  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  62.22 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  60.54 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  58.95 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  63.78 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  57.44 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  58.6 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  58.29 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  58.82 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  48.29 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  48.29 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  57.22 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  55.37 
 
 		 223 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 214 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 214 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  49.76 
 
 		 213 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  49.01 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 292 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 236 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  48.1 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  52.49 
 
 		 186 aa  191  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  54.4 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  51.09 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>