128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0275 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  51.3 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  45.24 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  44.73 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  43.8 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  47.91 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  46.95 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  46.95 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  37.54 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  45.22 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  38.92 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  43.79 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  38.08 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  42.36 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  38.95 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  42.59 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  40.98 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  40.06 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  38.17 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  41.14 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  42.94 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  41.4 
 
 		 569 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  35.97 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  35.09 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  34.17 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  36.87 
 
 		 266 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  39.11 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  42.41 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  36.97 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  30.22 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  35.77 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  39.5 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  28.91 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  31.89 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  26.32 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  30.59 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  30 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  30 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1612  septum site-determining protein MinD  29.8 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00643531  normal  0.221579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  28.77 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 		 270 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  25.47 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  26.79 
 
 		 269 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  33.55 
 
 		 271 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  31.13 
 
 		 271 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3873  septum site-determining protein MinD  29.14 
 
 		 270 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.748671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  24.18 
 
 		 270 aa  49.7  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 		 269 aa  49.7  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  25.84 
 
 		 269 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  24.18 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  28.57 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  24.4 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  32.26 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.68 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  24.57 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  29.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  28.57 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1078  septum site-determining protein MinD  23.33 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000761328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1694  septum site-determining protein MinD  28.48 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  27.81 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  28.44 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  24.68 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  27.81 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  25.11 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  27.15 
 
 		 269 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  27.83 
 
 		 271 aa  46.6  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  27.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1234  septum site-determining protein MinD  28.48 
 
 		 271 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246291  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1633  septum site-determining protein MinD  27.57 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0820  response regulator receiver protein  27.47 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  28.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  28.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  28.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  27.22 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3562  septum site-determining protein MinD  28.95 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  23.56 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3238  septum site-determining protein MinD  28.95 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.442677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  28.99 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0034  septum site-determining protein MinD  28.08 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0320  septum site-determining protein MinD  28.3 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  27.39 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  34.23 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2035  septum site-determining protein MinD  29.82 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0125  septum site-determining protein MinD  29.24 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1991  septum site-determining protein MinD  31.58 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.15 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>