More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0235 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 830 aa  1695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.16 
 
 		 816 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  54.97 
 
 		 720 aa  718    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  53.19 
 
 		 693 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.95 
 
 		 840 aa  608  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 		 818 aa  598  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 		 817 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 		 816 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 		 816 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  43.25 
 
 		 810 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  43.44 
 
 		 830 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 		 831 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 		 831 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  43.58 
 
 		 828 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  42.84 
 
 		 824 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.17 
 
 		 761 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  38.11 
 
 		 726 aa  376  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.31 
 
 		 814 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.66 
 
 		 789 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 871 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  32.58 
 
 		 801 aa  334  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.85 
 
 		 784 aa  333  5e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  32.95 
 
 		 773 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 		 695 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.61 
 
 		 880 aa  328  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 877 aa  325  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.54 
 
 		 821 aa  324  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 747 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 		 820 aa  321  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  37.56 
 
 		 680 aa  317  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 766 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  34.11 
 
 		 892 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 801 aa  312  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 819 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 739 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  32.18 
 
 		 821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 758 aa  310  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  32.96 
 
 		 833 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 807 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  32.84 
 
 		 721 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 758 aa  300  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.66 
 
 		 744 aa  297  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 705 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  32.06 
 
 		 740 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.96 
 
 		 737 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.14 
 
 		 763 aa  274  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.9 
 
 		 817 aa  273  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 710 aa  269  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  30.63 
 
 		 838 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 736 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 1057 aa  264  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  29.01 
 
 		 807 aa  258  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 703 aa  256  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  32.36 
 
 		 771 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 759 aa  254  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 700 aa  253  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  29.77 
 
 		 727 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  30.27 
 
 		 768 aa  243  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.46 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.03 
 
 		 773 aa  242  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  29.83 
 
 		 765 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  29.24 
 
 		 722 aa  237  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  29.39 
 
 		 772 aa  233  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.41 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  29.3 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 766 aa  230  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  30.6 
 
 		 724 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.69 
 
 		 890 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  29 
 
 		 750 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.36 
 
 		 648 aa  222  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  28.71 
 
 		 836 aa  220  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.4 
 
 		 680 aa  220  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.99 
 
 		 905 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.82 
 
 		 723 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 692 aa  218  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  28.08 
 
 		 658 aa  217  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  29.41 
 
 		 719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 741 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 		 626 aa  215  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  29.04 
 
 		 775 aa  214  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.63 
 
 		 661 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  28.91 
 
 		 734 aa  211  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  27.61 
 
 		 770 aa  210  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.91 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.43 
 
 		 761 aa  207  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  29.75 
 
 		 808 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  30.85 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  29.5 
 
 		 726 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.48 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  27.64 
 
 		 712 aa  204  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  26.97 
 
 		 705 aa  203  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.31 
 
 		 646 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  26.97 
 
 		 718 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.35 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  27.17 
 
 		 727 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  28.88 
 
 		 735 aa  200  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>