More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0223 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  65.47 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  65.47 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  65.47 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  64.23 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  63.31 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  61.31 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  61.31 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  60.58 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  60.87 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  59.42 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  59.42 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  62.04 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  59.42 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  60.58 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  59.85 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  60.43 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  60.87 
 
 		 142 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  60.29 
 
 		 139 aa  159  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  58.7 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  58.7 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  58.7 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  59.12 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  59.12 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  60.87 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  60.28 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  60 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  60.14 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  57.97 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  60.29 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  59.57 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  59.57 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  61.76 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  59.71 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  64.75 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  57.55 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  59.42 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  56.93 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  59.85 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  59.12 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  57.25 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  57.25 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  61.83 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  57.35 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  59.57 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  59.12 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  56.62 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  58.39 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04764  redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.2 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  58.16 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  59.85 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  58.39 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  64.23 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  56.12 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  59.85 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  56.2 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  60.28 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  57.55 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  58.99 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  58.7 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001046  organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.15 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  58.7 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  55.71 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  57.35 
 
 		 190 aa  146  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  58.21 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  54.68 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  54.68 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  58.09 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  56.74 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  59.12 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  58.7 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  55.4 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  55.88 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  58.7 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  58.7 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  55.8 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  57.66 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  57.55 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0231  putative organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  57.97 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2314  OsmC family protein  54.41 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.158438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  54.01 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  58.39 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  56.83 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  56.93 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  55.07 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>