More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0127 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  54.61 
 
 		 322 aa  352  5e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  48.13 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  44.34 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  37.04 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  39.53 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  36.89 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 615 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  36.33 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  34.44 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 633 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  30.25 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.95 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 455 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.02 
 
 		 754 aa  79  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.99 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  28.64 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.65 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.1 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.26 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  27.97 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  27.97 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  27.54 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.61 
 
 		 700 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  35.24 
 
 		 954 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.97 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 1739 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.09 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  32.33 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.3 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0708  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0812  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 997 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40 
 
 		 946 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  22.48 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 366 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 350 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2791  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 401 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 334 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.77 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.97 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.35 
 
 		 729 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.91 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.32 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  23.25 
 
 		 731 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  32.17 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 1239 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 671 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.17 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>