More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0100 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  100 
 
 
300 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  66.11 
 
 
301 aa  320  1e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  54.46 
 
 
305 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  54.4 
 
 
311 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  50.81 
 
 
306 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  49.03 
 
 
315 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  47.42 
 
 
315 aa  246  5e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  48.22 
 
 
324 aa  239  3e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  47.92 
 
 
349 aa  238  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  48.23 
 
 
318 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  48.7 
 
 
326 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  46.82 
 
 
312 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  48.84 
 
 
327 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  45.81 
 
 
309 aa  234  1e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  48.22 
 
 
318 aa  233  2e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  49 
 
 
316 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  46.98 
 
 
305 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  45.78 
 
 
315 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  45.78 
 
 
315 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  45.78 
 
 
315 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  47.39 
 
 
317 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  45.42 
 
 
321 aa  221  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  51.27 
 
 
318 aa  221  1e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  51.75 
 
 
314 aa  221  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  47.7 
 
 
314 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  47.74 
 
 
322 aa  215  6e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  45.94 
 
 
335 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  48.88 
 
 
314 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  40.66 
 
 
280 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  41.33 
 
 
358 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.19 
 
 
371 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  47.7 
 
 
311 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
356 aa  188  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.63 
 
 
358 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.29 
 
 
356 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  184  2e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  46.15 
 
 
277 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  46.15 
 
 
277 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  45.42 
 
 
277 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.78 
 
 
359 aa  181  9e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.48 
 
 
358 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.78 
 
 
359 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  45.85 
 
 
306 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
280 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  42.07 
 
 
276 aa  174  2e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  35.82 
 
 
277 aa  173  3e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.63 
 
 
368 aa  173  3e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  43.38 
 
 
372 aa  173  4e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  39.26 
 
 
360 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  38.75 
 
 
359 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.37 
 
 
360 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.94 
 
 
303 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.55 
 
 
272 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.09 
 
 
311 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  41.07 
 
 
386 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.7938e-09  hitchhiker  6.00467e-09 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  39.41 
 
 
371 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  37.74 
 
 
325 aa  166  3e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  39.42 
 
 
288 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  39.34 
 
 
393 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.86 
 
 
286 aa  165  7e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  39.05 
 
 
288 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  37.5 
 
 
365 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.87 
 
 
364 aa  165  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.69 
 
 
311 aa  164  1e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  37.87 
 
 
364 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.87 
 
 
367 aa  165  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.5 
 
 
364 aa  164  2e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.36 
 
 
373 aa  164  2e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  37.13 
 
 
364 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  34.8 
 
 
278 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.5 
 
 
364 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  37.13 
 
 
365 aa  162  5e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  39.26 
 
 
374 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  35.96 
 
 
385 aa  162  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  39.26 
 
 
360 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  38.6 
 
 
393 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  40.07 
 
 
274 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.95 
 
 
359 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2048  Prephenate dehydratase  39.7 
 
 
383 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.01 
 
 
362 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.41 
 
 
371 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.55 
 
 
365 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  38.15 
 
 
355 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.04 
 
 
371 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  33.7 
 
 
274 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.68391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  37.41 
 
 
382 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.87 
 
 
364 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  42.65 
 
 
706 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.78 
 
 
371 aa  158  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  37.78 
 
 
371 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.18 
 
 
364 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.04 
 
 
371 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  38.15 
 
 
366 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.41 
 
 
361 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.27 
 
 
360 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0175  Prephenate dehydratase  42.68 
 
 
328 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.36 
 
 
283 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  36.03 
 
 
382 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.8 
 
 
387 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36.84 
 
 
413 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>